Témata pro PhD práci 2011
Ústav pro histologii a embryologii 1.LF UK nabízí zájemcům o hlubší poznání
v oboru Biologie a patologie buňky doktorské studium.
Témata vycházejí z následujících stěžejních vědeckých projektů řešených na ústavu:
1) Morfogenese cévní trubice - morfologické a molekulární aspekty
Projekt navazuje na nové poznatky o vzniku cévního lumina při vaskulogenesi - novotvorbě cév při embryonálním vývoji (1-4). Práce bude zaměřena na vznik apiko-bazální polarity endothelu, dynamiku přestavby mezibuněčných spojení a zrání mezibuněčné hmoty cév. Na myší embryonální aortě bude sledována exprese markerů apikální a bazální cytoplasmatické membrány (podocalyxin, CD34, integriny, selectiny), lokalizace a charakter mezibuněčných spojení pomocí detekce ZO-1 proteinu, claudinu, beta-cateninu a cadherinů. Během vývoje aorty se zaměříme rovněž na charakteristiku glycocalyx a jeho možnou roli při luminizaci cév (3). Při zrání mezibuněčné hmoty budeme mj. sledovat časovou následnost exprese fibronectinu, lamininu a kolagenu IV.
2) Luminizace srdeční trubice
V rámci řešení problematiky časného vývoje srdce u myši (event. jiných obratlovců) se pokusíme ověřit, zda-li tento proces probíhá pomocí stejného mechanismu, jako bylo nedávno demonstrováno u aorty (2).
3) Morfologické změny myokardu při fibrilaci síní
Tento projekt si klade za cíl zjistit morfologické změny charakterizující myokard (především síňový) u pacientů s atriální fibrilací (5). Budou se sledovat především změny postihující endomysium (např. charakteristika cévního řečiště - změny endothelu, fibróza - role PDGF, pericytů atd.)
Metody použité pro oba projekty:
Světelná mikroskopie a konfokální mikroskopie: klasická histologická barvení parafinových řezů, histochemie, imunohistochemie. Elektronová mikroskopie. Kvantitativní metody: morfometrie, stereologie a obrazová analýza.
Školitel: MUDr. Tomáš Kučera, Ph.D.
Spolupracující pracoviště: Fyziologický ústav AV ČR, IKEM - Kardiocentrum,
Institut für Stoffwechselphysiologie, Heinrich-Heine-Universität, Düsseldorf, Německo
Projekty jsou součástí výzkumného záměru:
MSM0021620807 Metabolické, endokrinní a genetické aspekty prevence, diagnostiky a terapie kardiovaskulárních, cerebrovaskulárních a renovaskulárních onemocnění –
řešitel prof. Škrha
Další financování předpokládáme z grantů GAČR a GAUK na základě přihlášek podaných společně doktorandem a školitelem, příp. z budoucí institucionální podpory 1.LF UK.
Relevantní publikace:
1) Kučera T., Strilić B., Regener K., Schubert M., Laudet V., Lammert E.: Ancestral vascular lumen formation via basal cell surfaces. PLoS ONE 4 (1):e4132, 2009.
2) Strilić B., Kučera T., Eglinger J., Hughes M.R., McNagny K.M., Tsukita S., Dejana E., Ferrara N., Lammert E.: Vascular lumen formation in the developing aorta. Developmental Cell 17(4):505-515, 2009
3) Strilic, B., Eglinger, J., Krieg, M., Zeeb, M., Axnick, J., Babal, P., Muller, D.J., and Lammert, E. Electrostatic cell-surface repulsion initiates lumen formation in developing blood vessels. Curr Biol 20(22): 2003-2009, 2010.
4) Strilić B., Kučera T., and Lammert E.: Formation of cardiovascular tubes in invertebrates and vertebrates. Cellular and Molecular Life Sciences, 2010, vol. 67, no. 19, pp. 3209-3218
5) Aldhoon B, Melenovsky V, Kucera T, Martinek J and Kautzner J. Occurrence of Atrial Fibrillation in Advanced Heart Failure Reflects Increased Atrial Wall Stress Rather Than Fibrosis. Circulation. 2009;120(18):S818-S.
Kontakt:
MUDr. Tomáš Kučera, Ph.D.
Ústav pro histologii a embryologii 1. lékařské fakulty UK
Albertov 4
Praha 2 PSČ 128 00
tel.: +420224968130
e-mail:tkucer@lf1.cuni.cz
