Na Lékařské fakultě UK v Plzni je možné studovat dva magisterské studijní programy - Všeobecné lékařství a Zubní lékařství. Přihlášky se podávají vždy do konce února. Uchazeči, kteří si podali přihlášku na Lékařskou fakultu UK v Plzni, skládají přijímací zkoušky z fyziky, chemie a biologie formou písemného testu. Z každého předmětu odpovídají na 25 otázek, celkem tedy 75 otázek. Test je koncipován tak, že u každé z otázek jsou nabízeny 4 odpovědi, pouze jedna z nich je správná. Uchazeč správnou odpověď zaškrtne do skórovacího protokolu. Na test má uchazeč 135 minut čistého času. Po skončení časového limitu uchazeč odevzdá test.

Všeobecné lékařství

Délka studia:     6 let

Titul:         MUDr.

První dva roky lékařského studia jsou věnovány teoretickým oborům – biologii, biofyzice, anatomii, histologii, fyziologii a biochemii. Ve třetím a v části čtvrtého ročníku se studují preklinické předměty – Patologická anatomie, Patologická fyziologie, Mikrobiologie, Farmakologie a začíná klinická výuka. Nejvyšší ročníky jsou plně věnovány klinickým oborům. V 6. ročníku stážují studenti v rámci blokové výuky v nemocnicích v Plzeňského, Jihočeského a Severočeského kraje.

Zubní lékařství

Délka studia:     5 let

Titul:         MDDr.

Do studijního programu Zubní lékařství jsou uchazeči přijímáni od akademického roku 2004/2005, toto studium postupně nahradilo studijní program Stomatologie.

Studenti jsou vychováváni nejen pro výkon lékařské praxe, ale seznamují se i se základy vědecké práce a jsou i k samostatné vědecké práci vedeni. V průběhu studia, zejména o letních prázdninách, má řada studentů možnost absolvovat studijní pobyty a praxe v zahraničí.

Na fakultě rovněž probíhá výuka v angličtině pro zahraniční studenty samoplátce.

Studium je ukončeno  slavnostní promocí ve staroslavném Karolinu v Praze, kde se  absolventům předávají diplomy.